眉山药科职业学院奉行“创立学生向往的学校，培养社会满意的学生，办出特色鲜明的教育”的办学宗旨，秉承“药学中西，厚德济世”的校训，坚持“以教学为中心，以教师为主体，以学生为根本，以质量为生命，以特色求发展”的教育理念，弘扬“自强不息、追求卓越”学校精神，立足“五个融入”，促进“五个对接”，加强“五大建设”，实现“五个合作”，着力为医药卫生企事业单位培养技术型、技能型、应用型的专门人才，努力打造执业药师的摇篮。学院目前开设了药学、中药学、中药栽培技术、药品质量与安全、药品经营与管理等专业，形成药学为主、多学科协调发展的格局，这些专业与市场紧密结合，培养目标明确、课程体系科学、教学管理规范。
基础医学部由解剖学与组胚学，生理学，微生物学与免疫学，生物化学与分子生物学，病理学与病理生理学，医学统计学，临床医学及心理学等学科组成，这些学科都是医学和药学的重要基础课程，要成为个合格的医学和药学人才，必须要有坚实的基础知识和基本的技能，基础医学部就是一个培养技术型、技能型、应用型医药人才的摇篮。
目前基础医学部拥有雄厚的师资队伍，有教授6名，副教授3名，具有博士、硕士学位11人，四川省学术和技术带头人1人， 四川省卫生厅学术和技术带头人1人。实验室面积达3000平方米，有交互式显微镜实验室4个，SD-人体解剖学实验室2个，生物化学与分子生物学4个，来源：www.cdjtxy.net，机能实验室4个，形态学实验室4个。有一流的教学设备，包括交互式显微镜160台；HF-24可移动机能实验平台24台；人体标本模型300多件，完全满足教学需要。
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